对于运行MySQL，推荐使用FreeBSD 4.x或更新版本，因为其线程包更加完整。要想遇到一个安全、稳定的系统，你应当只使用标记-RELEASE的FreeBSD内核。
最容易因此是比较受喜欢的安装方法是使用mysql-server和mysql-client移植，可从http://www.freebsd.org得到。
使用这些移植的益处包括：
· 用pkg_info -L察看哪个文件被安装的能力
· 如果你在那台机器上不再想要MySQL，用pkg_delete完全删除它们。
建议在FreeBSD 2.x版上使用 MIT-pthreads，在版本3和以上版本用原生线程。在一些2.2.x的以后版本使用原生线程运行是可能的，但是你可能碰到mysqld关掉的问题。
遗憾的是，FreeBSD调用的某些函数还不能完全保证线程安全。特别令人注意的是，包括gethostbyname()函数， MySQL使用该函数将主机名转换为IP地址。在某些环境中，mysqld进程会突然造成100%的CPU负荷，不再响应。如果你遇到该问题，尝试使用--skip-name-resolve选项启动MySQL。
另外，还可以将FreeBSD 4.x中的MySQL同LinuxThreads库连接，这样可以避免一些原生FreeBSD线程执行时的问题。为了更好地将LinuxThreads同原生线程进行对比，参见Jeremy Zawodny的文章FreeBSD or Linux for your MySQL Server? 地址：http://jeremy.zawodny.com/blog/archives/000697.html 。
在FreeBSD使用LinuxThreads的已知问题有：
· 连接时间(wait_timeout、interactive_timeout和net_read_timeout)值不理想。现象是永久连接挂起较长时间，不能关闭，只有线程执行新命令时 'kill'线程方有效。
这可能是线程库中的信号处理问题，信号不能中断挂起的读命令。期望在FreeBSD 5.0中修复。
MySQL构建进程需要GNU make(gmake)工作。如果没有GNU make，必须在编译MySQL前先安装它。
建议的在FreeBSD中用gcc(2.95.2和以上版本)编译和安装MySQL的方法是：
CC=gcc CFLAGS="-O2 -fno-strength-reduce" \ CXX=gcc CXXFLAGS="-O2 -fno-rtti -fno-exceptions \ -felide-constructors -fno-strength-reduce" \ ./configure --prefix=/usr/local/mysql --enable-assembler gmake gmake install cd /usr/local/mysql bin/mysql_install_db --user=mysql bin/mysqld_safe &
如果configure使用MIT-pthreads，应当阅读MIT-pthreads注意事项。请参见2.8.5节，“MIT-pthreads注意事项”。
如果你从make install遇到一个它不能找到“/usr/include/pthreads”的错误，configure没有检测出你需要MIT-pthreads。要修复该问题，移走config.cache，然后用--with-mit-threads选项重新运行configure。
确定让你的名字解析程序安装正确，否则当连接mysqld时，你可能会遇到解析延时或失败。保证在“/etc/hosts”文件中的localhost入口是正确的。“/etc/hosts”文件应该以下面一行开始：
127.0.0.1 localhost localhost.your.domain
已知FreeBSD的文件句柄限制默认值很低。请参见A.2.17节，“文件未找到”。使用--open-files-limit选项执行mysqld_safe启动服务器，或在/etc/login.conf为mysqld用户提高限制并用cap_mkdb /etc/login.conf重建它。如果你不使用默认名(即使用chpass mysqld-user-name)，还要保证为该用户设置在密码文件中的相应级别。请参见5.1.3节，“mysqld_safe：MySQL服务器启动脚本”。
FreeBSD将进程空间限制到512MB，即使系统有很多的可用RAM也如此。因此你可能会遇到如下所示错误：
Out of memory (Needed 16391 bytes)
在当前版本的FreeBSD(至少4.x和更高版本)中，你可以在/boot/loader.conf文件中增加下面的条目并重启机器增加该限制(不能在运行时间用sysctl命令更改这些设定值)：
kern.maxdsiz="1073741824" # 1GB kern.dfldsiz="1073741824" # 1GB kern.maxssiz="134217728" # 128MB
在旧版本的FreeBSD中，必须重新编译内核，以便更改进程的最大数据段空间。在这种情况下，应当查看LINT配置文件中的MAXDSIZ选项查看更详细的信息。
如果MySQL的当前日期有问题，设置TZ变量将会有帮助。请参见附录F：环境变量。