与MySQL服务器4.1版或更高版本建立连接时，最好使用MySQL Connector/J 3.1版，这是因为它全面支持较新版本的服务器提供的特性，包括Unicode字符、视图、存储程序和服务器端预处理语句。
尽管3.0版Connector/J能够与MySQL服务器4.1或更高版本建立连接，但由于实现了Unicode字符和新的鉴定机制，将无法更新Connector/J 3.0以支持当前和未来服务器版本中提供的新特性。